In 1945 wordt Weijnen benoemd tot rector van het Norbertuslyceum in Roosendaal. En van 1946 tot zijn benoeming in Nijmegen in 1958 is hij vast docent Nederlands aan de Katholieke Leergangen in Tilburg, vanaf 1956 als rector. Per 1 september 1958 wordt Weijnen benoemd als gewoon hoogleraar aan de Katholieke Universiteit Nijmegen, met als leeropdracht: “Nederlandse en Indogermaanse taalkunde”, later uitgebreid tot: “Algemene, interlinguale en Nederlandse dialectkunde, alsmede de vergelijkende Indo-europese taalwetenschap”. Weijnen heeft zich ontwikkeld tot een autoriteit op het gebied van Brabantse dialecten en letterkunde (zie levensbericht: http://dialect.ruhosting.nl/weijnen/LevensberichtFac.pdf ).
Antonius (Toon) Weijnen is in 1937 gehuwd met Maria Hoefnagels. Voor de oorlog uitbrak werden Mira en Beatrys geboren, toen hij op 13 juli 1942 werd geïnterneerd in Haaren was het derde kind op komst. Hij werd ondergebracht op de Ie etage nr. 103 code Civ (civiel).
Antonius Angelus (Toon) Weijnen overleed op 9 februari 2008 in zijn woonplaats Malden, 98 jaar oud. Tot enkele jaren voor zijn overlijden publiceerde hij nog en beoefende zijn vak volop. Hij was weduwnaar van Maria Hoefnagels met wie hij van 1937 tot haar dood in 1989 gehuwd was; ze kregen vijf kinderen, waarvan de jongste vroeg overleed