Op 18 jan 1943 werden de klokken uit de kerktoren gehaald op last van de bezetter. De grote klok had een gewicht van 428 kg en een middellijn van 86,5 cm. Opschriften waren: Petit et Fritsen Me fuderunt 1891 en St. Lambertus Patronus. Ook stond darop een beeld van deze heilige en een kruisbeeld en op twee ringen een engelenhoofd. De kleine klok woog 112 kg had een middellijn van 45 cm en geen opschriften, maar was in dezelfde jaar vervaardigd door dezelfde maker. Ook een klokje uit de pastorie met een gewicht van 20 kg en een diameter van 24 cm, gemerkt met de letters cc werd klaargezet. De klokken hebben ongeveer een maand onder de toren gestaan en zijn op 16 feb 1943 afgevoerd. (inv.nr. 67)
Verwoesting en herstel van de kerk
Later tijdens de Tweede Wereldoorlog, om precies te zijn op 26 okt 1944, werd de kerktoren door terugtrekkende Duitse troepen opgeblazen. De ravage aan toren en kerk was enorm. De gemeente Vught, waartoe Cromvoirt sinds 1933 weer was gaan behoren, wilde de kerk afbreken. Het bisdom besloot echter om de kerkruïne te herstellen. Zolang de noodkerk niet op orde was, werd de mis opgedragen in het pakhuis van de molen welke zich bevond aan een zijstraatje van de Lambertusstraat. In de zomer van 1948 waren de plannen en tekeningen van architect G. Koesen gereed. Daarop werd de kerktoren gedeeltelijk herbouwd en de kerk hersteld. In 1950-1951 werd het interieur hersteld en vernieuwd. Door de enorme kosten en geringe middelen van het kerkbestuur zag men naderhand af van volledig herstel van de kerktoren. Deze toren is dus na het herstel altijd ten halve gebleven.